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虚拟筛选介绍

虚拟筛选(virtual screening,VS)也称计算机筛选,即在进行生物活性筛选之前,利用计算机上的分子对接软件模拟目标靶点与候选药物之间的相互作用,计算两者之间的亲和力大小,以降低实际筛选化合物数目,同时提高先导化合物发现效率。通过虚拟筛选可以有效减少试验筛选化合物数量,降低研发成本,缩短研发周期。CSNpharm运用快速准确且行业领先的软件工具和计算方法,配备经验丰富的技术团队,根据客户的需求,量身定制高性价比的服务方案,为广大科研客户提供优质的早期药物研发服务。

这些服务可以根据保密条款以及与客户商定的其他特定条件签订合同。

虚拟筛选流程

从原理上来讲,虚拟筛选可以分为两类,即基于受体的虚拟筛选(Receptor-based virtual screening)基于配体的虚拟筛选(Ligand-based virtual screening)

基于受体的虚拟筛选从靶蛋白的三维结构出发,研究靶蛋白结合位点的特征性质以及它与小分子化合物之间的相互作用模式,根据与结合能相关的亲合性打分函数对蛋白和小分子化合物的结合能力进行评价,最终从大量的化合物分子中挑选出结合模式比较合理的、预测得分较高的化合物,用于后续的生物活性测试。

基于配体的虚拟筛选一般是利用已知活性的小分子化合物,根据化合物的形状相似性或药效团模型在化合物数据库中搜索能够与它匹配的化学分子结构。最后对这些挑选出来的化合物进行实验筛选研究。

服务内容

CSNpharm向广大具有虚拟药物筛选需求的客户提供整套虚拟药物筛选服务,客户只需提供靶标相关的生物学信息,我们将为您筛选最优的活性化合物,为进一步的生物活性评价奠定基础。

同源建模

靶点信息调研

基于配体的药物筛选和基于受体的药物筛选

人工挑选

小分子化合物库的组建和制备

服务优势

丰富的分子模拟和药物设计经验

多款药物设计软件和强大的计算能力

数据交付快且结果可靠

严密的隐私数据保护

可提供1,300万+的实体化合物

可提供批量定制服务

可提供生物活性测试服务

数据库资源举例

虚拟筛选库类别分子数量特点
CSNpharm Bioactive Compound Library5,888CSNpharm活性化合物数据库,含有5,888种已知高活性的化合物集合,结构多样,是老药新用、新适应症筛选的有效工具
CSNpharm FDA-approved Compound Library1,951CSNpharm FDA上市药物库,包含1,951个上市药物,可用于高通量以及高内涵筛选,是老药新用研发的常用工具
Specs Screening Collection350,000350,000多个筛选化合物库存,由单一合成的、表征良好的药物样小分子组成
OTAVA Screening Collection270,000超过270,000种用于高通量筛选(HTS)的化合物,包括超过300个以靶标为重点的文库(蛋白激酶、蛋白酶、GPCR、离子通道、表观遗传靶标等)以及片段文库、Lead-like、Drug-like和CSNpharm化合物等
Life chemical Screening Collection525,608>500,000筛选化合物;51,000片段化合物;>100有针对性和重点的筛选化合物库,12,500砌块,1,300新颖的骨架结构
Enamine Screening Collection2,878,335为生物筛选提供世界上最大的筛选化合物集合Enamine筛选集合目前包含2,878,335种低分子量有机化合物
Covalent Screening Library81,111来自Enamine,旨在成为效果良好的共价粘合剂的最可靠来源
Maybridge Screening Collection53,000来源于Maybridge,包含53,000种高度多样的类先导化合物,是药物筛选的有效工具
Vitas-M Screening Collection1,400,000140万新颖的筛选化合物集合,可以用于药物筛选
Allosteric GPCR Library14,400来自Enamine专为发现新型变构配体而设计
InterBioScreen Screening Collection550,000来自美国的高性价比的新颖筛选化合物,有68,000种天然产物
RNA Focused Library4,400Life Chemicals开发了其RNA筛选库,其中包含4,400多种具有预测RNA结合活性的类药物化合物,作为转录后基因调控、抗菌和抗病毒药物发现研究的绝佳起点
STING Targeted Library1,600Life Chemicals所选择的1,600类药筛选包括该库符合RO5-并且不包含反应性和毒性基团潜在STING激动剂和拮抗剂的化合物。对接分数值可用于应要求提供的化合物结构文件中的每个化合物
Nuclear Receptor Screening Library11,000Life Chemicals开发了两个专门的核受体筛选库,用于核受体研究中的药物发现筛选项目:核受体对接库和基于核受体配体的2D相似性文库
Anticancer Screening Compound Library6,300Life Chemicals抗癌筛选库包含6,300多种具有潜在抗肿瘤活性的新型药物样筛选化合物,针对各种癌症类型,例如前列腺癌和乳腺癌、白血病、淋巴瘤、癌。它被设计为一个有用的工具,高通量筛选(HTS)在抗癌药物研发
CSNpharm Screening Library9,900Life Chemicals CSNpharm筛选库包含近9,900种结构多样、可能渗透CSNpharm的化合物,这些化合物是从专有的HTS化合物集合中精心挑选出来的
Fsp³-enriched Screening Compound Library51,000Life Chemicals Fsp 3富集的筛选化合物库旨在响应最近的发现,这些发现表明有机化合物的分子复杂性和手性中心在其成为合适候选药物的潜力方面的重要作用
Natural Product-like Compound Library2,900Life Chemicals分为通过相似性搜索的天然产物类化合物库和通过化学信息学和子结构搜索的天然产物类化合物库
Covalent Inhibitor Library17,800Life Chemicals提供了包含超过17,800种用于共价筛选的小分子筛选化合物的通用共价抑制剂库,这些化合物选自Life Chemicals HTS化合物集中的特定结构部分(官能团),有时也称为“弹头”,已知会形成共价键与靶蛋白结合位点的氨基酸残基(例如,Cys、Ser、Lys、Tyr)结合
Cysteine Focused Covalent Inhibitor Library3,400Life Chemicals以Cys为重点的筛选化合物库是在特定结构部分的基础上创建的,这些部分可以与药物靶标的半胱氨酸残基可逆或不可逆地反应。它包含超过3,400种潜在的共价修饰符
Serine Focused Covalent Inhibitor Library1,300Life Chemicals增强初始活性分子的效力和选择性的有效策略是通过与亲核残基形成共价键,该残基对感兴趣的靶标具有特异性,并且理想情况下不显示脱靶相互作用。这种共价结合化学探针越来越多地用于蛋白质组范围的目标识别和成像,以及在相关酶和酶同种型中寻找具有高度特异性的抑制剂
Scaffolds and Scaffold-based Compounds141,300Life Chemicals提供基于1,300个新型Scaffold(包括500多个优质Scaffold)的140,000个新型小分子筛选化合物的原始库存集合,用于药物化学和药物发现筛选项目
BACE Library7,171Enamine专为发现新型BACE抑制剂而设计
DNA Library5,530Enamine设计用于鉴定针对DNA稳定性必不可少的蛋白质的新活性物质
RNA Library15,520Enamine能够与RNA结合的化合物库

CSNpharm虚拟筛选服务可以显著提高先导化合物命中率并降低后期的实验筛查成本。虚拟筛选技术服务是一种个性化定制的创新型的科研服务,每个项目需经评估后才能确定对应的分析方案和价格。进一步了解服务价格或技术详情等信息,请发邮件至sales@csnpharm.cn或直接联系CSNpharm的销售人员。

联系电话(同微信):13916454823